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Erschienen in: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology 16/2023

14.08.2023 | Research

Construction and validation of an efferocytosis-related prognostic signature in lung adenocarcinoma

verfasst von: Jian Liu, Li Wei

Erschienen in: Journal of Cancer Research and Clinical Oncology | Ausgabe 16/2023

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Abstract

Background

Accumulating evidence highlights the potential significance of efferocytosis in tumor progression. This study is directed towards the construction of a prognostic risk model for lung adenocarcinoma (LUAD), grounded on efferocytosis-related genes (ERGs).

Methods

Employing LASSO-COX regression analysis, a risk-prognostic model was formulated, centered on seven ERGs. Concurrently, a nomogram was established that incorporated patient clinical features and risk scores. The predictive accuracy of the risk model and the nomogram was substantiated via external validation sets. The landscapes of immune infiltration and genetic mutation were evaluated for high- and low-risk groups, with the expression of seven key genes validated through RT-PCR.

Results

Our findings reveal that the high-risk group displayed considerably inferior survival outcomes in comparison to the low-risk group. A diminished abundance of immune cell infiltrates and a higher prevalence of gene mutations characterized the high-risk group. Genes with high expression were markedly enriched in pathways related to cell proliferation. The superior predictive performance of the risk model and nomogram was adequately substantiated by the external validation sets (GSE31210, GSE30219, and GSE50081). In addition, we discerned several potential therapeutic drugs demonstrating different sensitivities across patient risk groups. The differential expression of seven central genes was confirmed in A549, H1299, and BEAS-2B cell lines.

Conclusion

The constructed risk model and nomogram display high accuracy in predicting the survival and immune landscape of LUAD patients, thus providing invaluable prognostic tools in clinical scenarios.
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Literatur
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Metadaten
Titel
Construction and validation of an efferocytosis-related prognostic signature in lung adenocarcinoma
verfasst von
Jian Liu
Li Wei
Publikationsdatum
14.08.2023
Verlag
Springer Berlin Heidelberg
Erschienen in
Journal of Cancer Research and Clinical Oncology / Ausgabe 16/2023
Print ISSN: 0171-5216
Elektronische ISSN: 1432-1335
DOI
https://doi.org/10.1007/s00432-023-05251-7

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